本发明公开了一种耐病毒甘薯种间渐渗系的培育方法。所述方法利用广亲和性亲本徐薯18,与抗病毒的甘薯野生种进行种间杂交,保证杂交数量和利用杂交处理液处理的基础上,获得种间杂种实生种子,然后对获得杂种F1群体进行跟踪鉴定,选择抗SPVD的真杂种为母本,栽培种徐薯18为轮回亲本进行连续回交2~3代,构建BC3F1或BC4F1群体,最后对BC3F1或BC4F1群体进行抗性鉴定和标记分析,获得耐病毒渐渗群体BC3F1或BC4F1。本发明突破了甘薯传统遗传群体构建方法,拓宽了甘薯遗传基础,可以以较小群体规模构建高密度的遗传图谱,减少应用过多标记等人力、物力的花费,可以用于构建遗传作图群体及抗SPVD品种改良。